LP_OKM_GEN

Pracovní příručky/Kompletní pracovní příručka

číslo dokumentu

: OKM_VYS_1_23

verze dokumentu

: 01

platí od

: 03.06.2017

sestaveno

: 15.03.2023

Centrální laboratoře Fakultní nemocnice Bulovka, Budínova 67/2, 180 81 Praha 8

 

MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE                                                           Průkaz DNA / RNA (PCR)

Herpetické infekce
(krev / mok / stěr / plodová voda / jiné)

HSV 1, HSV 2

CMV - kvantitativně (EDTA krev! )

VZV

EBV - kvantitativně (EDTA krev! )

Respirační infekce
(výtěr / BAL / výplach / mok / sputum, aspirát)

 

Influenza A, Influenza B, RSV (respirační syncycyální virus)

COVID-19 PCR

 

Panel CAP (komunitní pneumonie)
(Streptococcus pneumoniae, Hemophillus influenze, Chlamydia pneumoniae, Legionella pneumophila, Mycoplasma pneumoniae, Bordetella pertussis, Bordetella parapertussis)

 

Panel RESPIRAČNÍ PATOGENY – multiplex PCR z výtěru  (FilmArray) - obsahuje Covid 19

Adenovirus , Covid 19, Coronavirus 229E, HKU1, NL63, OC43, MERS-CoV,  Metapneumovirus , Rhinovirus / Enterovirus, Influenza A,B, Parainfluenza virus,,  RSV, Bordetella pertusis, Bordetela parapertussis, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae

 

Panel PNEUMONIA plus - multiplex PCR (FilmArray)
BAKTERIE: Acinetobacter calcoaceticus/baumannii complex, Enterobacter cloacae complex, Escherichia coli, Haemophilus influenzae, Klebsiella aerogenes, Klebsiella oxytoca, Klebsiella pneumoniae group, Moraxella catarrhalis, Proteus spp., Pseudomonas aeruginosa, Serratia marcenscens, Staphylococcus aureus, Streptococcus agalactiae, Streptococcus pneumoniae, Streptococcus pyogenes

ATYPICKÉ BAKTERIE: Chlamydia pneumoniae, Legionella pneumophila, Mycoplasma pneumoniae

VIRY: Adenovirus, Coronavirus (229E,HKU1,NL63,OC43),* Human Rhinovirus/Enterovirus, Human Metapneumovirus, Influenza A, Influenza B, Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS CoV), Parainfluenza Virus, Respiratory Syncytial Virus

GENY ANTIMIKROBIÁLNÍ RESISTENCE: Methicillin resistance (mecA/C,MREJ), Carbapenemases (KPC,NDM, Oxa-48-like, VIM, IMP)

* ESBL (CTX-M))

 

Aspergillus PCR

Mycobacterium TBC komplex

Mycobacterium sp.- atypická mykobakteria

Pneumocystóza mikr a  PCR PAR

 

Exantémové a dětské nemoci

Morbilli PCR (stěr, moč, sputum)

Parvovirus B19 PCR (stěr, EDTA krev, plodová voda)

Parotitis PCR (bukální stěr, moč,  sliny, mok)

Enteroviry PCR (stěr z puchýřků, výtěr z nosohltanu)

Virové hepatitidy

HBV kvantitativně (EDTA krev! )

HCV kvantitativně,  Genotypizace HCV  (EDTA krev! )

HEV PCR (sérum, stolice)

Neuroinfekce

(mozkomíšní mok, krev)

 

Panel bakteriálních meningitid (mok) - PCR multiplex

Haemophilus influenza, Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae, Streptococcus agalactiae, Listeria monocytogenes, E. coli)

 

Panel virových meningitid - PCR multiplex
(HSV-1 / HSV -2 / VZV)

 

Panel_LIKVOR - PCR multiplex (FilmArray)
BAKTERIE: E.coli K1, Haemophilus influenzae, Listeria monocytogenes, Neisseria meningitidis, Streptococcus agalactiae, Streptococcus pneumoniae

Viry: CMV, Enteroviry EV, HSV-1, HSV-2, HHV-6, Human Parechovirus HPeV, VZV

Fungi: Cryptococcus neoformans/gattii

 

Enteroviry PCR

 

Virus západonilské horečky (WNV) PCR

Borrelia - PCR (lze i synoviální tekutina)

 

Pohlavně přenosné infekce
(stěr, výtěr, sekret, moč)

Chlamydia trachomatis PCR

Neisseria gonorrhoeae PCR

 

Mycoplasma genitalium PCR
(
po tel. domluvě lze dovyšetřit geny rezistence k ATB)

 

Panel STI - PCR multiplex

Mycoplasma genitalium, Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum, Ureaplasma parvum, Trichomonas vaginalis

 

Panel uregonitální vřed – multiplex PCR

Treponema pallidum, Haemophilus ducreyi, LGV, Herpes simplex virus 1, 2, Varicella zoster virus, Cytomegalovirus

 

 Monkey pox PCR – opičí neštovice

 

Infekce cestovatelů

Panel Infekce cestovatelů PCR multiplex

Dengue, Chickungunya, Zika, West Nile virus


Panel stolice na parazity - PCR multiplex

Giardia lamblia, Entamoeba histolytica, Cryptosporidium, sp., Blastocystis hominis, Dientamoeba fragilis, Cyclospora cayetanensis

Parazitární infekce

 

Pneumocystóza mikr a  PCR PAR

PAME - Primární amébová meningoencefalitida

GAE - Granulomatózní encefalitida

Leishmanióza  - mikroskopie + PCR

Trichomonas vaginalis

Panel stolice na parazity - PCR multiplex

(Giardia lamblia, Entamoeba histolytica, Cryptosporidium, sp., Blastocystis hominis, Dientamoeba fragilis, Cyclospora cayetanensis)

 

Panel helmintóz -  PCR multiplex

(Enterocytozoon spp./Encephalitozoon spp., Strongyloides spp., Hymenolepis spp., Ascaris spp., Taenia spp., Trichuris trichiura spp., Ancylostoma spp., Enterobius vermicularis , Necator americanus)

 

Malárie PCR

 

Jiné

 

Clostridium difficile+ toxiny

Komplexní vyš. stolice před fekální transplantací – PCR multiplex

 

Panel HEMOKULTURA – multiplex PCR (FilmArray)

G+bakterie: Enterococcus faecalis /faecium, Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis /lugdunensis, Streptococcus agalactiae /pneumoniae /pyogenes

G-bakterie: Acinetobacter calcoaceticus+baumannii complex, Bacteroides fragilis, Enterobacterales, Enterobacter cloacae complex, Escherichia coli, Klebsiella aerogenes / pneumoniae group /oxytoca, Proteus sp., Serratia marcescens, Salmonella sp., Haemophillus influenzae, Neisseria meningitidis, Pseudomonas aeruginosa, Stenotrophomonas maltophilia

Fungi: Candida albicans /auris/ glabrata /krusei /parapsilosis /tropicalis/, Cryptococcus neoformans+gattii

ATB rezistence: karbapenemázy (IMP, KPC, OXA-48-like, NDM, VIM), Colistin rezistence (mcr-1), ESBL (CTX-M), Methicillin rezistence (mecA/C, mecA/C a MREJ (MRSA), Vancomycin rezistence (vanA/B)

 

 

Přímý průkaz antigenu

Virové gastroenteritidy

 Virové gastroenteritidy-průkaz viru ve stolici

SARS-CoV-2

 

COVID-19 antigen ve výtěru

COVID-19 antigen v krvi